回到太湖大学堂，弟子们护关，并由太湖大学堂秘书处于９月20日正式公告「怀师数十年来为法忘躯，近来四大违和，现正住于禅定」，这段入定期间，来自全球的重要弟子，都齐聚太湖大学堂。

9月29日，上海中山医院的医师到太湖大学堂，检查入定多日的南师，下午四点钟，正式开立死亡证明书，确定南师辞世。

在家家准备团圆的中秋节之夜，中华文化之当代集大成者——南公怀瑾大士荼毗仪式圆满结束，「朗朗皓月，文风不起，浓浓白烟，直奔禅堂，大士乘愿再来之意。」一路护送南师的弟子这样描述，薪尽火传，一代大师南怀瑾95岁的灿烂生命画下句点。